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  이 건 토지를 취득하기 위하여 지급한 분양대금 중 반환받은 쟁점금액이 취득세 과세표준에 포함되는지 여부
관리자 2021-07-28 오전 9:54:24   조회:118
[결정요지]

법원의 이 건 판결(2019.6.27.)에 따라 취득가격과 관련된 쟁점금액을 반환받은 사실이 확인되므로 이 건 토지의 취득세 과세표준이 되는 사실상 취득가격은 청구법인이 당초 납부한 금액에서 쟁점금액을 제외한 금액이 되는 것이 타당해 보임


관련법령 : 지방세법 제10조 제5항



[주문]

OOO구청장이 2020.3.5. 청구법인에게 한 취득세 등의 경정청구 거부처분은 이를 취소한다.



[이유]

1. 처분개요

가. 청구법인은 2015.7.21. OOO로부터 OOO토지 14,688㎡(이하 “이 건 토지”라 한다)를 분양받아 취득한 후, 2015.9.18. 처분청에 취득가액인 OOO원을 과세표준으로 하고 「지방세법」 제11조 제1항 제7호의 세율(4%)을 적용하여 산출한 세액에서

「조세특례제한법」(2014.12.23. 법률 제12853호로 개정된 것) 제120조 제4항 제3호 및 「조세특례제한법」(2014.12.23. 법률 제12853호로 개정된 것) 부칙 제72조에 따른 프로젝트금융투자회사가 2015.12.31.까지 취득하는 부동산으로 신고하여 취득세 등을 감면(50%)받고, 나머지 취득세 OOO원을 신고·납부하였다.


나. 서울고등법원은 OOO가 OOO원(이하 “쟁점금액”이라 한다)을 청구법인에게 지급하라고 판결(서울고등법원 2019.6.27. 선고, 2018나2009805 판결, 2019.7.13. 확정, 이하 “이 건 판결”이라 한다)을 하자,

청구법인은 2020.1.6. 쟁점금액을 차감한 금액을 이 건 토지의 과세표준으로 하여 이 건 취득세 등을 경정해야 한다는 이유로 경정청구를 하였으나, 처분청은 2020.3.5. 이를 거부하였다.


다. 청구법인은 이에 불복하여, 2020.4.16. 심판청구를 제기하였다.



2.청구법인 주장 및 처분청 등 의견

가. 청구법인 주장

청구법인은 OOO에게 이 건 토지 매매대금(OOO억원) 중 계약금(10%)은 계약체결시, 나머지 잔금(90%)은 계약체결 후 365일이 되는 날에 지급하기로 하고, 납부기한을 초과할 경우 지연손해금을 부담하기로 하는 용지매매(변경)계약을 체결하였고, 이후 일부 잔금을 위 납부기한까지 지급하지 못하여 그에 대한 지연손해금을 부담하였다.

이후 청구법인은 이 건 토지의 면적․형상 등이 확정되지 않은 상태에서 용지매매(변경)계약을 체결하는 등 분양절차에 문제가 있었고, 이에 따라 대출금 확보 등 정상적인 자금마련에 어려움이 있어 위 지연손해금을 부담한 것으로 이는 부당하다는 취지로 OOO를 상대로 부당이득금반환소송을 제기하였다.

이에 서울고등법원은 위 지연손해금이 발생한 것에 청구법인은 귀책사유가 크지 않다는 이유로 청구법인이 위 지연손해금 전부를 부담하는 것은 과다하므로 OOO는 쟁점금액에 해당하는 금액을 청구법인에게 반환하라는 이 건 판결을 하였고, 조세심판원도 반환받은 부당이득금은 취득세 과세표준이 되는 실제 취득가격에서 제외된다는 결정(조심 2017지882, 2017.10.30., 같은 뜻임)을 하였다.

따라서 청구법인이 이 건 판결을 받아 반환받은 쟁점금액은 이 건 토지의 과세표준에서 제외되는 것이 타당함에도 처분청은 이 건 토지의 취득세 납세의무 성립일 이후에 쟁점금액을 반환받았다는 이유만으로 이 건 경정청구를 거부한 처분은 부당하다.


나. OOO

처분청이 인용한 판결(대법원 2004.10.15. 선고 2003두9008)은 과점주주에 대하여 부과되는 취득세는 주식의 취득에 따른 과점주주의 성립이라는 과세요건이 구비됨으로써 당연히 발생하고, 일단 적법하게 주식을 취득하면 이후에 주식양도계약이 합의해제 되거나, 해제조건의 성취 또는 해제권의 행사 등으로 소급적으로 실효되었다고 하더라도 이미 성립한 조세채권의 행사에 아무런 영향을 줄 수 없다는 것으로 이 건과는 그 사실관계가 다르다 할 것이고,

조세심판원에서도 부당이득금반환 소송을 제기하여 판결을 받아 기 납부한 금액을 반환받은 경우에는 취득세 과세표준에서 제외되는 것이 타당(조심 2017지882, 2017.10.30., 같은 뜻임)하다는 점 등에 비추어 보면,

이 건 토지의 취득세 과세표준이 되는 사실상 취득가격은 청구법인이 당초 신고․납부한 금액에서 쟁점금액을 제외한 금액으로 하는 것이 타당하다.


다. 처분청 의견

「지방세법」 제10조 제1항 및 제5항에서 법인장부 등에 따라 사실상 취득가격이 증명되는 취득의 경우에는 사실상의 취득가격을 취득세 과세표준으로 하도록 규정하고, 같은 법 시행령 제18조 제1항에서 취득가격은 취득시기를 기준으로 그 이전에 해당물건을 취득하기 위하여 거래 상대방 또는 제3자에게 지급하였거나 지급하여야 할 직간접비용의 합계액으로 하도록 규정하고 있으며,

법원은 위 규정의 과세표준은 취득당시의 가액을 기준으로 하는 것으로 납세의무가 적법하게 성립하였다면 이후에 합의해제 등의 사정으로 계약이 소급적으로 실효되더라도 당초 납세의무에는 영향이 없다고 판결(대법원 2004.10.15. 선고 2003두9008, 같은 뜻임)하고 있다

따라서, 청구법인이 쟁점금액을 이 건 판결에 따라 쟁점금액을 반환받았다 하더라도 이는 이 건 토지의 납세의무일 이후에 소급하여 실효된 것으로 위 법원판례에 따라 이미 적법하게 성립한 취득세에는 영향이 없는 것이므로 처분청이 이 건 경정청구를 거부한 처분은 정당하다.



3.사실관계 및 판단

가. 쟁 점

이 건 토지를 취득하기 위하여 지급한 분양대금 중 반환받은 쟁점금액이 취득세 과세표준에 포함되는지 여부

나. 관련 법령 : <별지> 기재

다. 사실관계

(1) 청구법인과 처분청이 제출한 심리자료에 의하면 다음과 같은 사실을 알 수 있다.

(가) 등기사항전부증명서에 의하면, 청구법인은 본점 소재지를 OOO로 하고, 목적사업을 이 건 토지 소재지 일대에서 지식산업센터의 신축과 분양하는 사업 등을 영위하기 위하여 2014.12.24. 설립된 것으로 나타난다.

(나) 용지매매계약서에 의하면, OOO주식회사(매수자)와 OOO(매도자)는 2013.7.25. OOO일대 토지 14,688㎡를 다음과 같이 매매하는 계약을 체결(주요내용만 발췌)하였다.

(다) 권리의무승계계약서에 의하면, 이 건 토지의 용지매매계약에 따른 권리의무(이 건 토지의 부당이득금 소송[서울중앙지방법원 2014가합570023] 당사자 지위승계까지 포함)는 OOO(매도자) 입회하에 2013.7.25. OOO주식회사(매수자)에게, 2015.3.20. OOO주식회사(매수자)로, 다시 2015.7.21. 청구법인(매수자) 순으로 승계된 것으로 나타난다.

(라) 변경계약서에 의하면, OOO는 2014.6.5. OOO개발계획 및 실시계획변경인가를 고시하였고, 같은 날 청구법인과 OOO는 위 고시를 반영(건축물의 용도․건폐율․용적율 등의 변경사항)한 변경계약(주요내용만 발췌)을 다음과 같이 체결한 것으로 나타난다.

(마) 용지분양금 납부내역서에 의하면, OOO는 2015.7.22. 청구법인으로부터 이 건 토지의 매매대금으로 원금 OOO을 다음과 같이 지급받았다는 내용의 납부내역서를 발급하였다.

(바) 청구법인은 2015.7.21. 이 건 토지를 취득한 후, 2015.9.18. 취득가액인 매매대금 OOO원을 과세표준으로 하고 「지방세법」 제11조 제1항 제7호의 세율(4%)을 적용하여 산출한 세액에서 감면(50%)을 적용하고, 나머지 과세분에 대한 취득세 OOO원을 신고·납부하였다.

(사) 청구법인(원고)은 OOO(피고)를 상대로 부당이득금 반환 소송을 제기하였고, 서울고등법원으로부터 2019.6.27. 다음과 같이 원고 승소판결(주요내용만 발췌)을 받았다.

(아) 청구법인은 2019.3.7., 2019.7.5., 2회에 걸쳐 OOO로부터 이 건 판결에 따른 쟁점금액과 그 이자 OOO원을 지급받았다.



(2) 이상의 사실관계와 관련 법령 등을 종합하여 살펴본다.

(가) 「지방세법」 제10조 제5항에서 다음 각 호의 취득에 대하여는 제2항 단서 및 제3항 후단에도 불구하고 사실상의 취득가격 또는 연부금액을 과세표준으로 한다고 규정하면서 그 제3호에서 판결문·법인장부 중 대통령령으로 정하는 것에 따라 취득가격이 증명되는 취득을 규정하고 있고,

같은 법 시행령 제18조 제3항에서 법 제10조 제5항 제3호에서 대통령령으로 정하는 것이란 다음 각 호에서 정하는 것을 말한다고 규정하면서 그 제1호에서 판결문 : 민사소송 및 행정소송에 의하여 확정된 판결문을 규정하고 있다.

「지방세기본법」 제50조 제1항에서 과세표준 신고서를 법정신고기한까지 제출한 자는 과세표준 신고서에 기재된 과세표준 및 세액이 「지방세법」에 따라 신고하여야 할 과세표준 및 세액을 초과할 때에는 법정신고기한이 지난 후 5년 이내에 최초 신고한 지방세의 과세표준 및 세액의 결정 또는 경정을 처분청에 청구할 수 있다고 규정하고 있다.


(나) 처분청은 청구법인이 이 건 토지의 취득세 납세의무성립일 이후에 쟁점금액을 반환받은 이상 이미 적법하게 성립한 취득세 납세의무와는 관련이 없다는 의견이나,

청구법인은 이 건 토지를 OOO로부터 2015.7.21. 취득하고 법정신고기한(2015.9.19.)내에 이 건 취득세 등을 신고․납부하였고 그로부터 5년 이내인 2020.1.6. 받환 받은 쟁점금액을 과세표준에서 제외하여 달라고 적법하게 경정청구를 한 점,

이후 법원의 이 건 판결(2019.6.27.)에 따라 취득가격과 관련된 쟁점금액을 반환받은 사실이 확인되므로 이 건 토지의 취득세 과세표준이 되는 사실상 취득가격은 청구법인이 당초 납부한 금액에서 쟁점금액을 제외한 금액이 되는 것이 타당해 보이는 점,

처분청이 제시한 판결은 취득세 등의 납세의무성립 여부에 관한 것이고 사실상 취득가격(대법원 2004.10.15. 선고 2003두9008 판결)의 범위에 관련된 것이 아니므로 이 건과는 그 사실관계가 다른 점 등에 비추어,

쟁점금액은 이 건 토지의 취득세 과세표준에서 제외하는 것이 타당하므로 처분청이 청구법인의 이 건 경정청구를 거부한 처분에는 잘못이 있는 것으로 판단된다.



4.결 론

이 건 심판청구는 심리결과 청구주장이 이유 있으므로 「지방세기본법」 제96조 제6항과 「국세기본법」 제81조 및 제65조 제1항 제3호에 의하여 주문과 같이 결정한다.
 
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329   쟁점건축물의 취득 신고 과정에서 처분청의 안내가 없어서 취득세 등을 과소신고하였으므로 이 건 가산세 부분을 취소하여야 한다는 청구주장의 당부 관리자 28
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325   ①청구법인이 종전사업과 같은 종류의 사업을 영위하는 것으로 보아 창업중소기업 감면의 적용을 부인한 처분의 당부 ②납부불성실가산세의 기산일이 유예기간 종료 후 30일이 경과한 날의 다음 날로 보아야 한다는 청구주장의 당부 관리자 53
324   이 건 토지를 취득하기 위하여 지급한 분양대금 중 반환받은 쟁점금액이 취득세 과세표준에 포함되는지 여부 관리자 118
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